学院甘肃中医学院是1978年经国务院批准成立的省属普通本科院校，具有硕士学位授予权和培养留学生资格。学院设直属和非直属附属医院6所，教学医院、实习医院48所，实习药厂和种植基地8个，实习床位15000多张。中国医学史馆、中药标本馆、敦煌中医药馆、人体标本馆被国家科技部、中宣部、教育部、中国科协确定为全国青少年科技教育基地。
学院设有基础医学院、临床医学院、药学院、中医医疗系、针灸推拿系、中西医结合系、临床医疗系、管理系、藏医学院、护理学院、继续教育学院、公共课部（社科部），教育技术与网络通讯中心等教学部门。设有中医基础理论、中医临床基础、方剂学、中医内科学、中医外科学、中医骨伤科学、中医妇科学、中医儿科学、针灸推拿学、中西医结合临床、中药学等11个硕士学位点、12个本科专业（或方向）、14个专科专业，各类在校学生7千多人，其中普通本、专科学生4305人。
学院现有教学楼3栋，行政办公楼1栋，实验楼2栋，图书馆大楼1栋，学生公寓楼8栋，教职工住宅楼7栋，总建筑面积近12万平方米。教育技术与网络通讯中心有线电视教学网覆盖全部教室，电话进入学生公寓，并已建成千兆计算机校园网。图书馆藏书22.3万余册，各类期刊1100多种