学院设有基础医学系、中医系、药学系、针灸推拿系、护理系、管理系、生命科学系、计算机科学技术系、临床医学系（筹）和成人教育学院、滨江学院。
设有中医内科学、中医临床基础等博士点2个。
中医学（中西医学临床、七年制）专业和中医学（中西医学临床、学制五年）、针灸推拿学（国际针灸推拿、学制五年）、临床医学（学制五年）、中药学（新产品开发、学制四年）、药物制剂（学制四年）、药学（学制四年）、护理学（学制四年）、卫生事业管理（学制四年）、生物科学（学制四年）、计算机科学与技术（学制四年）等本科专业11个。
中医学（中西医学临床、学制三年）、中药学（贸易、学制三年）、中医高等护理学（学制三年）及卫生事业管理学（学制三年）等专科专业4个。
中医基础理论、中医临床基础、中医内科学、中医妇科学、中医儿科学、中医五官科学、中医骨伤科学、针灸推拿学、中西医结合基础、中西医结合临床、中药学、中医诊断学、内科学、药理学等硕士学位点14个。
中医临床基础学是省级重点学科，中药学、中西医结合临床学、针灸推拿学被列为省级重点扶植学科。